冻干机适用于热敏和受热易变型变性的物质。如生物领域：药品、疫苗、血清、血浆、抗体、微生物、植物提取物等。非生物领域：食品、纳米颗粒、胶体、植物、文物等。 真空冷冻干燥食品加工工艺（以下简称为冻干技术）被业界*为先进的食品加工技术，经过冻干机加工后的产品能够保留其原有食品的颜色和味道，易于运输，便于贮藏，能够极大的降低成本，冻干机加工后的食品也并未流失其原有的营养成分。
出口冻干机包含的冻干技术中涉及的参数主要有：有物性参数和过程参数。有物性参数即为原料的导热系数、比热容和密度等；过程参数主要有预冻速率、干燥室真空度和料盘装载量等。就冻干机预冻速率来说，在冻结食品原料的过程中，原料表面会根据冻结时间和冻结温度而生成不同缝隙大小的冰状体颗粒物，这种颗粒物的间隔缝隙与大小在后期深加工时会直接影响干燥速度。
在冻干机慢速冷冻情况下，原料细胞外会产生结晶，此时细胞外水分以固体形式存在，而细胞内水分仍以液态形式存在，在内外压强不平衡的情况下将会挤压细胞内活性水向细胞外扩散，此时就会造成细胞壁破损，细胞内营养物质外泄，从而影响食品的质量。在冻干机工艺优化方面，应该以快速冷冻的方式代替慢速冷冻。
在冻干机快速冷冻的方式下，冰状物结晶生成速度远远大于细胞内活性水被挤压到细胞外的速度；此时生成的冰状物结晶细小，密度小，缝隙小，在细胞壁外生成了一层冰状屏障，能够阻挡营养物质的外泄。实施快速冷冻的原材料上附着的冰状物结晶较少，也会大大提高干燥速度，从而减少干燥时间，获取更高的效益。
生产商应该根据食材的类别、切片厚度和重量选择干燥方式。冻干机食品加工中，应该注意冷冻加工时间，并且要在冷冻加工完进行保温，保温时间一般为 1 h，保证食品的冻结效果。为了维持冻干效果，应根据产品的冻干程度选择不同设计的包装袋，防止食品在运送过程中变质。
